Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms