Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms