Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T4

ARHGEF39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF39Q8N4T4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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