Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms