Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms