Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms