Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms