Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TREML4Q6UXN2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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