Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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