Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225Q6GV28 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms