Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms