Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM46CQ5VWP2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms