Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms