Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCTE1Q5JU00 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCTE1Q5JU00 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms