Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms