Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RNF212Q495C1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RNF212Q495C1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RNF212Q495C1 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RNF212Q495C1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RNF212Q495C1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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