Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF8Q3BBV2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF8Q3BBV2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF8Q3BBV2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF8Q3BBV2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF8Q3BBV2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF8Q3BBV2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF8Q3BBV2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF8Q3BBV2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms