Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHKAPQ2M3C7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
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