Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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