Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms