Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CRY1Q16526 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CRY1Q16526 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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