Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK5Q16478 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms