Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNIP1Q15025 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNIP1Q15025 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms