Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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