Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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