Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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