Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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