Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC098617.1-207ENST00000594591 810 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 RLN2-201ENST00000381627 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AL133325.2-201ENST00000431034 449 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC092718.5-201ENST00000562450 593 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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