Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms