Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD47Q08722 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD47Q08722 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms