Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC023194.3-201ENST00000522679 277 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.125-201ENST00000618659 283 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TMEM161B-207ENST00000509387 963 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms