Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms