Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms