Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms