Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms