Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms