Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms