Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms