Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB1P82279 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms