Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms