Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2FP61218 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms