Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CABP4P57796 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CABP4P57796 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CABP4P57796 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CABP4P57796 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CABP4P57796 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CABP4P57796 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CABP4P57796 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CABP4P57796 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CABP4P57796 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CABP4P57796 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CABP4P57796 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms