Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms