Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP4P49662 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASP4P49662 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASP4P49662 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASP4P49662 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP4P49662 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP4P49662 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms