Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTAP49354 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNTAP49354 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms