Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms