Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A2P43004 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms