Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms