Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms