Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBRP36941 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms